CCDC:剑桥晶体数据中心
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产品介绍

● 致力于推进化学和晶体学的发展,以造福社会。
● 专注于科学结构数据的收集、保存和应用,用于药物发现、材料开发,以及科研教育领域。
● 收集并发布了剑桥结构数据库(CSD),这是一个经过认证的可信数据库。
● CSD 中包含了超过100万个精心矫正和管理的有机和金属有机晶体结构,以供全球的研究人员使用。
● CCDC的软件使科学家能够从海量的数据集中提取宝贵的知识,并利用这些知识加速研发流程。

  • Mogul 小分子构象分析工具

    基于超过100万个小分子晶体结构的CSD数据库

    可以分析当前构象键长、键角以及二面角的合理性

    查看键长、键角和二面角的合理分布

    查看相同原子类型的键长、键角及二面角的晶体结构

  • GOLD

    基于遗传算法将柔性配体对接到蛋白结合位点当中

    内置于CSD-Discovery 中,借由蛋白可视化工具 Hermes 提供图形用户界面

  • SuperStar 相互作用预测工具

    帮助用户识别蛋白质结合位点内或小分子(配体或辅因子)周围的区域

    生成突出显示交互热点的3D图

    使用来自剑桥结构数据库 (CSD) 或蛋白质数据库 ( PDB ) 的分子间相互作用的真实信息

    内置于CSD-Discovery Suite 中的Hermes蛋白可视化工具中

  • IsoStar 基于片段的相互作用分析工具

    基于超过100万个小分子晶体结构的CSD数据库和蛋白-小分子结构数据库PDB

    统计不同分子片段在数据库中出现的高频相互作用

    可以同时基于CSD和PDB数据库进行分析

    基于CSD或PDB的统计分析合适的相互作用距离、角度等

    在CSD或PDB数据库中查看相关晶体结构

  • 小分子可视化及分析工具

    通过多种方式进行小分子可视化分析

    分析晶体Packing 方式,范德华和氢键相互作用

    连接到CSD-Core、CSD-Discovery、CSD-Materials 以及CSD Python API,并直接使用相应功能模块

    进行数值分析及统计

  • Hermes 大分子结构可视化工具

    为大分子的3D结构(包括蛋白、抗体和核苷酸等)提供高分辨率的可视化界面

    分析结合位点、编辑修饰小分子和辅因子

    连接到GOLD、Mogul、SuperStar和CSD Ligand Overlay模块,并可直接打开使用

    可以对GOLD的对接结果分析,并可产生高质量的图片,用于发表

  • CrossMiner 药效团模型构建和搜索

    快捷易用的药效团构建和搜索

    可以同时对CSD、PDB以及您的私有数据库进行药效团搜索

    可以定制药效团特征

    交互式的用户界面

  • Python API CSD数据库Python接口

    CSD的Python接口,可直接命令行应用相关功能

    可以定制化脚本

    用户可在第三方软件中无缝访问CSD数据库,并使用CSD数据库的功能

  • IsoStar 蛋白小分子相互作用数据库

    通过多种方式进行小分子可视化分析

    分析晶体Packing 方式,范德华和氢键相互作用

    连接到CSD-Core、CSD-Discovery、CSD-Materials 以及CSD Python API,并直接使用相应功能模块

    进行数值分析及统计

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