MarvinSketch-化学结构处理和信息学分析-康昱盛

产品介绍

MarvinSketch是匈牙利化学信息学公司ChemAxon开发出的一款专业的化学结构编辑工具，同时也是ChemAxon众多软件产品中最早发布的一款。上市以来，其随着ChemAxon在化学信息学领域的不断拓展而不断迭代优化，陆续整合了ChemAxon其他产品的优势功能。如今的MarvinSketch已经成为了一款集结构绘制与编辑、结构属性预测、构象分析、名称转换等多种功能于一体的综合化学信息学工具。

支持各种不同类型化合物的绘制

MarvinSketch提供了各种常用的化学结构绘制工具，如原子、键、缩写基团、常用结构模板等，这些工具可以帮助我们快速绘制各种不同类型的化合物（如络合物、轴手性等）。而且MarvinSketch具备极好的可拓展性，用户可完全自定义相关界面显示、结构模板和缩写基团，这能够极大的提高我们日常绘制相关结构的效率。

支持各种不定结构和Markush结构的绘制

除了常规结构以外，科研人员同时也会经常绘制各种不定结构和Markush结构。MarvinSketch可以方便的编辑绘制出各种不同形式的不定结构和Markush结构，并且能够直接枚举出Markush结构空间中的具体化合物结构以方便相关研究人员分析。

支持反应式和反应机理的绘制

在日常的结构绘制中，反应式和反应机理的绘制会占有相当大的比重。MarvinSketch不仅可以快速绘制出反应式，并且可以对该反应式进行Auto Map，方便研究人员查看分析反应前后分子的变化。

结构的检查和自动修正

另外，针对结构绘制中可能会出现的结构错误或不规范的情况，MarvinSketch整合了 Structure Checker功能，可以帮助用户直接检查和修正结构中绘制错误和不规范的部分。

支持多肽和RNA的绘制

除了对小分子的良好支持外，MarvinSketch同时支持多肽、RNA等大分子的绘制。用户可以将多肽或RNA序列直接导入进MarvinSketch中从而实现相关大分子的快速绘制和编辑。

除了化学结构的绘制以外，MarvinSketch同时整合了ChemAxon其他化学信息学工具中的功能，以方便相关人员对绘制或导入的结构直接进行相关分析。

结构与名称相互转化

MarvinSketch整合了ChemAxon Naming技术，能够实现IUPAC名、通用名、CAS号和结构的相互转换，可帮助用户准确快速的实现化学名称的识别和结构转化，能够极大的提高日常提取和编辑化学相关文档的效率。

图片结构识别

除了有将文献中的化学名称转化为化学结构的需求以外，诸多研究人员同时还有将文献中的图片结构转为可编辑的结构的需求。基于此，MarvinSketch与图片结构识别工具OSRA进行整合，可将导入进来的图片直接转化为可编辑的结构，提升研发人员的工作效率并便于直接进行后续的结构分析或建库。

化学结构属性的计算预测

MarvinSketch整合了ChemAxon Calculator Plugins的所有计算预测模型，能够直接调用相关模型来预测化合物的各种重要理化性质（如Pka、LogS、LogD等）和异构体（互变异构、立体异构、共振异构等），可帮助研究人员更好地分析和评估相关候选分子。(点击查看MarvinSketch支持的所有计算包）

构象分析

MarvinSketch中可直接调用ChemAxon的分子构象计算模块来预测绘制结构的可能构象和相应能量，并能够进行3D Alignments和简单的动力学分析，以方便用户分析分子的三维构象并能为接下来的对接和分子模拟提供先验知识。

Office办公软件中的结构插入与编辑

另外，考虑到科研人员的日常办公需求，MarvinSketch可通过与ChemAxon专业的化学智能办公插件Marvin OLE和JChem for Office联用实现office文档中化学结构的快速插入与编辑，能够极大地提高科研人员的办公效率。

除了以上丰富而强大的化学信息学功能以外，MarvinSketch本身还额外包含MarvinView和MolConvert两个附属工具。MarvinView可以帮助我们快速地浏览和编辑SDF文件，MolConvert则可以实现各种化学结构格式文件的快速批量转换。

整体而言，整个MarvinSketch Suits可以满足研究人员日常科研工作中的绝大多数结构绘制和化学信息学方面的需求，极大地提供科研工作效率。