脂质组学是一个应用于疾病研究、药物发现和生物标志物识别的新兴系统生物学领域。质谱是用于脂质鉴定和定量最先进的技术。然而,质谱分析过程中的大量数据是质谱技术的主要挑战。脂质组数据质谱分析最重要的方面是利用前体和产物离子数据进行粗脂质提取和结构鉴定的高通量分析。
脂质的多样性和巨大的数量,脂质分子种类的结构分析非常具有挑战性。分析来源于生物的复合脂质提取物并得到显示在一定生物条件下脂质种类成分变化的数据图表,例如,刺激受体活化、疾病发展、正常细胞与转化细胞间的对比。由于脂质表征的技术限制,表征整个细胞或者组织的脂质是非常具有挑战性的工作。
SimLipid 是一款高通量的脂质定性和定量分析软件。它可以按照指定的内部标准对数百个脂质MS,MS/MS和MSE进行结构分析,校正实验峰值强度(同位素重叠)以及脂质定量分析。该程序有助于内源性/外源性脂质作为内部标准规范化。该程序可以识别text,MS Excel, mzData, mzXML, Waters' MSE, DDA 格式的数据,以及BrukerDaltonics 本地文件 (fid, baf and yep),AB SCIEX 二进制文件(*.t2d and *.Wiff ),Thermo Scientific 源文件格式(.RAW) 和Agilent's Compound Exchange File (CEF)。 该软件通过搜索SimLipid数据库中的已知脂质结构信息进行脂质鉴定和性能分析。同时还会给出一些相关参考信息,例如脂质ID,缩写,系统名称,成份以及其他数据库链接。
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