时间: 2026年11月12日(周四)
换一个偶联位点,重新搭建一个模型;换一组位点,再重复一遍。
如果还要比较不同DAR、不同linker–payload组合,需要手工构建多少个ADC结构?
对于开展ADC结构研究的研发人员来说,困难不仅是“如何建出一个模型”,更是:
怎样把一系列设计方案,高效地变成可供分析的三维结构?
设计空间很大,重复操作不该占据大量时间。
换一个偶联位点,重新搭建一个模型;换一组位点,再重复一遍。
ADC由抗体Antibody、连接段Linker和载荷Payload组成,但一个具体的ADC模型,还需要明确载荷接在哪里、接多少,以及连接后的空间构象。
当研究从单个方案扩展到多个候选方案时,建模工作也随之增加:
选择偶联残基、接入linker–payload、处理局部结构、检查空间冲突,再保存结果。换一个位点组合,又要重复这些操作。
我们真正需要的,是让程序承担重复建模工作,让研发人员把时间放在方案设计和结果判断上。

ADC Builder:从逐个搭建,到批量生成
本次讲座将介绍基于MOE全新开发的ADC Builder,展示如何将抗体结构与linker–payload组合起来,批量构建不同偶联位点和DAR的ADC结构。
整个流程包含四个环节:
① 生成偶联后的非天然氨基酸:利用化学反应规则,将氨基酸与linker–payload连接,生成用于后续建模的非天然氨基酸(NNAA)。新的反应规则还可通过RXN文件扩展。
② 建立侧链构象库:对NNAA进行构象搜索,为柔性的连接段和载荷准备可用于结构嵌入的构象。
③ 准备抗体结构:获得并准备抗体起始结构,明确需要研究的偶联位点。
④ 自动构建ADC变体:在指定位置进行NNAA替换和构象嵌入,生成不同偶联组合的ADC模型,并集中输出为MOE结构数据库。
关键变化是:研究人员定义建模方案,程序批量执行重复操作。
选定一组位点,能生成多少种方案?
以8个可独立选择的偶联位点为例,每个位点都有“偶联”或“不偶联”两种状态,理论上可枚举 256种位点组合,其中包含未偶联的参考结构。
如果将4组预定义的成对位点作为选择单元,则对应 16种组合,形成偶数DAR的代表性结构方案。
这些数字背后的价值,是将原本需要逐个处理的组合,转化为可以自动枚举、批量构建的建模任务。
当然,枚举出的结构候选并不意味着每种方案都具有相同的实验可行性。批量建模首先解决的是“把方案建出来”,为后续比较建立结构基础。

生成的ADC变体可以保存为MOE结构数据库,将三维结构与位点信息、DAR等字段关联起来,便于浏览、管理和后续计算。
这意味着,研究人员不必停留在分散的单个模型上,而可以围绕一组设计方案,系统开展结构比较。

结构库建好之后,还能回答哪些问题?
▶ 同样的DAR,换一个偶联位置,表面性质会不会不同?
▶ 连接在不同位置的载荷,运动方式是否一样?
▶ 连接在不同位置的载荷,运动方式是否一样?
我们将在讲座中结合案例展开。
本次ADC Builder专题讲座,将重点介绍:
从反应规则和构象库出发,完成ADC结构构建的流程;
如何定义偶联位点,批量生成不同位点与DAR组合;
结构数据库的输出,以及后续分析案例。
如果你正在研究多种ADC偶联方案,希望减少重复搭建模型的工作,欢迎参加。
让程序解放双手,把时间留给设计
讲座时间:
11月12日(周四) 15:00-16:00
报名方式:
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