LAMP Designer为LAMP设计高效引物,LAMP可以在等温条件下扩增DNA和RNA序列,避免了PCR的温度设置需要。这项技术依赖自动循环和DNA聚合酶介导的链置换DNA合成,不到一小时的时间内可以将DNA从几份扩增到109数量级。逆转录环介导等温扩增技术(Reversed Transcription-Loop Mediated Isothermal Amplification, RT-LAMP)可以用来扩增RNA序列。
LAMP采用四种专门设计的引物(两个内部和两个外部引物)识别靶基因的六个显著区间。 四条引物与靶基因的杂交是决定LAMP效率的关键步骤,因此这四条引物的设计是影响实验成功的关键。
避免交叉同源性
LAMP Designer自动注释BLAST搜索结果,在设计引物时并避免根据与数据库有显著交叉同源性的区域。
BLAST验证
通过BLAST搜索可以验证引物的特异性。
多重LAMP引物集合
为一个序列设计引物,可以进行检查是否试用于多重PCR实验。LAMP Designer程序会显示出多重PCR实验引物间形成最稳定二聚体时的自由能。
结果导出
设计的引物集合以及他们的属性可以导出为标准的CSV或Excel格式。
数据和数据库管理
可以创建多个实验项目,多个实验数据可以通过为每一个实验创建单独的项目来进行管理。LAMP Designer可以维护包含序列信息和搜索结果的本地数据库。
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