药物的化学结构影响药物在人体内不同生物过程。这种行为可以用药物分子的重要物理化学性质来描述。这些药物特征的优化对于推进药物发现发挥着关键作用。
ChemAxon开发的Calculator Plugins提供了快速的、精确的、可通过训练集优化的基础理化性质（如logP, logD, pKa等）的计算和预测功能。另外它还包括NMR分子谱图的精准预测功能，对化学结构的解析和阐述十分有帮助。
用于评价各种拓扑相关的分子特征。包括简单的元素分析，化学结构主键，氢键以及其他的物理性质，拓扑极性表面积或者分子表面积描述符等。
· 氢键给体/受体计算
· 分子量和原子数
· 电荷和构象计算，
· 几何结构和休克尔计算等
药物的电离在药物药代动力学和药效学中具有重要作用。了解药物分子在不同pH值下的酸性/碱性解离常数（pKa）对定量描述电离作用是很重要的。
· 高精度的pKa计算以及pKa在不同pH值下的分布曲线
· 计算化合物在特定pH值下的存在形式
· 等电点计算
药物的油水分布系数严重影响药物的药代动力学行为。
· logP,
· logD,
· HLB计算
· Intrinsic solubility
· pH-dependent solubility (pH-logS plot)
· A qualitative solubility category
· 预测由最常见元素(H, C, N, O, F, Cl, Br, I, P, S, Si, Se, B, Sn, Ge, Te和As)组成的分子的13C和1H NMR谱
· 从JCAMP-DX文件导入和显示NMR谱
· 生成不同互变异构体
· 计算互变异构体的分布以及主要的互变异构体
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