Ingenuity Pathway Analysis (IPA)基于人工收集和整理的QIAGEN Knowledge Base，一直以来为广大研究者进行分子机理挖掘提供了重要的工具。为了能够提供最新、最全的研究证据，IPA每季度进行持续更新。新冠肺炎在全球的爆发和快速传播，也让全球顶尖科学家纷纷投入到COVID-19分子机理、药物和抗体研究中。IPA 2020年第二季度更新中除了新增~64,000条Findings，同时添加了进入COVID-19临床试验的74个分子，构建了70个SARS-CoV-2 蛋白与疾病或生物学功能相关的网络。
在IPA Disease Ontology 中添加了COVID-19，通过搜索‘COVID-19’可以快速查看在ClinicalTrials.gov网站注册的分子信息，同样基于这些分子可以构建其分子调控网络。
基于Gordon等发表在Nature上SARS-CoV-2病毒蛋白和宿主蛋白之间的相互作用[1]，QIAGEN采用基于QIAGEN Knowledge Graph 训练的机器学习算法构建了70个蛋白分子与生物学功能或疾病之间的网络。基于这些网络可以梳理SARS-CoV-2致病机理、挖掘潜在的药物靶点，例如从下图中可以快速查看Coagulation of blood, Apoptosis, Cell cycle progression 等相关网络。
IPA专家团队通过人工收集和整理，在此次更新中新增~64,000条findings，total findings达到了7.25Million，包括：
l 6 new canonical signaling pathways
l ~37,500 Expert findings
l ~17,700 Protein-protein interaction findings from BioGRID
l ~8000 Gene Ontology findings
l ~1700 Drug-to-disease findings from ClinicalTrials.gov
l ~1400 Target-to-disease findings from ClinicalTrials.gov
l ~325 Findings from Mouse Genome Database (JAX)
l ~170 Protein-protein interaction findings from IntAct
l 169 newly mappable chemicals
