IPA软件包含了很多功能,其中最基础的功能就是IPA的信息查询功能,包含基因和化合物信息查询、疾病与生物功能查询、通路与毒理学信息查询。
1、查询基因信息(以FASN基因为例)
FASN 是什么,其分子类型,表达位置,分子功能,参与通路等基本信息有哪些?
基因查询报告包括:基本信息,包含分子名称、家族、同义词、分子功能、亚细胞定位、分子参与通路、以FASN作为靶标的miRNA信息、最新研究进展。
结果如下图所示:
其他数据库对FASN的描述、GO功能聚类信息、药物信息…
对于文献库,IPA按研究方向不同分类列出,并且具体到详细的功能分类。图中参考文献一共有2450篇。
2、查询疾病信息
搜索框选择Diseases and Functions,输入相关疾病信息点Search即可查询,这里以Obesity为例。搜索结果如下:
搜索到的疾病信息会分为很多category,选择一个即可查看对应的相关分子信息,如下:
3、BioProfiler
BioProfiler 提供一个快捷的查询和筛选平台,帮助您快速找到感兴趣的疾病、功能、表型和各类分子间的关系和支持信息,并进一步将这些结果展示成互作网络。网络中的疾病和功能节点可以互动点击,并提供相关的背景信息、本体论分类和药物靶标信息。
BioProfiler 结果表格:在BioProfiler结果表格中您可以根据分子类型或分子和功能/疾病间的调控关系和一系列相关生物学背景进行筛选。