时间: 2022年07月15日(周五) ; 2022年07月29日(周五) ; 2022年08月12日(周五)
系列讲座主题:
主题一:小分子构象分析利器-Mogul 介绍及其在药物设计中的应用案例
主题二:强大的分子对接软件GOLD介绍及应用
主题三:利用CCDC软件进行构象生成及分子叠合
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一、小分子构象分析利器-Mogul 介绍及其在药物设计中的应用案例
Using Mogul to assess molecular geometry and the use cases in drug design.
时间:7月15日(周五)下午15:00-16:00
药物设计中,判断小分子构象的合理性是十分重要的。比如小分子和蛋白结合构象,可能在对接和打分中提示了较强的结合力,但是在真实的实验中却没有活性或者活性较差,其中一部分原因可能是因为对接程序和打分对于分子构象合理性的考虑不足。Mogul 是基于海量小分子晶体结构数据提炼的知识数据库,利用Mogul可以检查小分子构象中任何不常见的(unusual)的构象特征,比如不合理的二面角、键长及键角。本次在线讲座将介绍Mogul的功能特性,并用Mogul解释化合物的SAR数据、筛选合理的Docking 构象以及用于化合物的结构优化。
二、强大的分子对接软件GOLD介绍及应用
The introduction of GOLD and its advantages.
时间:7月29日(周五)下午14:30-15:30
GOLD 是一款知名的分子对接软件,凭借CCDC海量的晶体数据GOLD在分子结合构象生成、含有金属离子参与的体系对接等方面有强大的功能和优势。本次在线讲座将介绍GOLD特点和优势以及在药物设计中的应用案例。
三、利用CCDC软件进行构象生成及分子叠合
Conformer generation and molecular alignment.
时间:8月12日(周五)下午15:00-16:00
CCDC的Discovery 套件提供分子构象生成和叠合算法,通过借助超过100万的晶体数据库的知识和理解能够以极快的速度生成优良的分子构象。