在Excel中透视表是非常有用的工具，类似的，ChemAxon在最新的Instant JChem版本（16.10.3.0）中发布了透视表的功能，在Instant JChem中可以使用Pivot功能共建立透视表视图，方便按照不同方式浏览及分析数据。
数据透视表（Pivot Table）
数据透视表可以动态地将原始数据表格进行重排，按照需要设置行与列，对数据进行重新归类，并且计算新的行列定义值。例如下面的化合物生物活性实验结果，一行记录一次实验结果，一个化合物进行了多种生物测试，或者多次重复实验。
通过数据透视表可以将化合物的所有实验结果归纳成一行，这样可以直观的对比同一个化合物不同实验的结果，以及不同化合物的活性。在创建数据透视表时，选择字段作为透视表的行，该字段的值将定义新的行，例如选择Compound ID作为行，在透视表中一个化合物数据将作为一行。选择字段作为透视表的列，该字段的值将定义新的列，例如选择Target作为列，可以将不同实验测试转置为列。选择计算值，按照新的行列定义选择计算值，可以显示原始值，也可以利用函数进行一些计算，计算加合、平均值、最大值和最小值等等。
创建透视表（Pivot Table）
在Instant JChem中创建透视表非常简单，在对应的Schema右键可以选择新建Pivot entity，可以打开New Pivot Entity设置界面，在Original Entity中选择数据来源，然后选择需要作为Pivot表格行的字段，点击“As Row”，对于化合物结构，需要选择化合物的SMILES字段；选择需要作为Pivot表格列的字段，点击“As Column”；选择作为Pivot表格值的字段，点击“As Value”；点击“Finish”将新建一个Pivot entity。
New Pivot Entity设置项：
Display Name ：新建透视表的显示名称，默认为Data
Original Entity：在下拉菜单中选择数据来源表，在下方的窗口中显示所选数据表的字段及类型
As Row ：将选择字段设置为透视表的行值；可以选择多个字段对行进行定义
As Column ：将选择字段设置为透视表的列值；可以选择多个字段对列进行定义
As Value：将选择字段设置为透视表的值；可以选择多个字段对值进行定义
As Extra Value：将选择字段设置为附加值；可以选择多个字段对附加值进行定义
Allow creation of empty fields：控制创建空的透视表字段
Show empty rows：控制空行的显示
所有的透视表字段可以在Order中设置升序或者降序排列，对于值或者附加值字段，可以在Aggregation中选择函数计算值的加合、平均值、最大值和最小值。
在新建的Pivot表格中，在表格设置中将SMILES字段对应的Cell Renderer改为Structure Renderer从而将SMILES转换为化合物结构，得到最终的Pivot表格如下图所示：
数据检索：
Pivot table将通过多对一的关系与原始数据表建立关联关系。在Data tree中将新建的Pivot表格加入到原始数据表中，这样可以在原始数据表中新建视图，通过检索原始数据对Pivot表格进行检索。
数据更新
当原始表格数据更新时，可以通过Refresh Pivot Entity更新透视表中的数据。
数据导出：
通过数据导出可以将Pivot table中的数据保存到文件中，支持多种文件格式，例如xlsx, csv, tab等。数据导出同样通过Export to file wizard设置导出文件及字段等。
