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新型冠状病毒系列免费网络讲座: 人体中ACE2的表达揭示新冠病毒的病理机制

时间: 04月15日(周三) ; 04月22日(周三)

课程简介:
在上一期利用CLC Genomics Workbench进行新型冠状病毒(SARS-CoV-2)基因组分析的公开课后,许多听课的小伙伴都对“新型冠状病毒”这一热点问题的后续分析表现出极大的兴趣和热情,如果说病毒基因组分析让科研人员了解病毒本身,那么连接新冠病毒和人类的“桥梁”是什么,新冠病毒进入人体后会对产生哪些影响呢?
说到这,就不得不提到最近同样成为热点的血管紧张素转换酶2(Angiotensin Converting Enzyme 2, ACE2)。ACE2就是科研人员发现的“桥梁”,它是新型冠状病毒的主要宿主细胞受体,在病毒进入细胞并造成感染的过程中扮演十分重要角色。通过研究ACE2在人体中的表达和分布情况,就可以进一步分析新冠病毒在人体内影响了哪些生物通路,可能造成哪些组织损伤,又有哪些药物有潜力成为新冠候选治疗方式。
为了帮助大家的科研分析,我们紧接着新型冠状病毒基因组分析的内容,用三期网络讲座的时间,运用GENEVESTIGATOR和IPA软件工具,通过以ACE2为代表的基因/蛋白,继续给大家详细介绍新冠病毒的后续病理机制分析。

主办单位: 上海康昱盛信息科技有限公司
时间: 4月15日15:00 -16:00
           4月22日14:30 -16:30

课程内容:
第一期:ACE2在不同组织中的表达情况、关联基因和潜在靶标药物

4月15日(周三)15:00 -16:00
本期课程将利用转录组表达谱挖掘平台GENEVESTIGATOR为大家展示ACE2在不同组织中的表达情况,揭示哪些组织最容易受到新冠病毒的损伤。找到ACE2的关联基因,通过探究影响ACE2表达的药物来挖掘潜在治疗新冠病毒的药物。
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第二期:运用IPA软件探究ACE2分子研究现状、探寻相关基因表达和新冠相关疾病之间的网络调控关系
4月22日(周三)14:30 -16:30
第一节:全面调查ACE2研究现状,构建新冠相关疾病潜在的生物通路网络
本期课程将利用生物通路分析软件(Ingenuity Pathway Analysis) IPA,首先进行ACE2分子的背景调查工作,全面了解ACE2分子研究现状。找到新冠相关疾病的关联基因,同时构建通路网络,探究ACE2相关基因与新冠相关疾病之间的关系,为后续新冠致病机制研究和相关药物开发提供参考。

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第二节:模拟并探索RNA-seq数据,为新冠分析提供借鉴意义
因为目前有关新冠表达数据较少,我们拟通过案例从最初的RNA-seq入手,将样本分对照组和实验组(效仿病毒患者和正常人的分组),通过IPA来探索不同condition的相关基因的表达情况(比如一类细胞,涉及不同时期的差异表达的相关调控因子以及涉及的功能的改变),并探索其生物学通路和做出解释,为新冠的快速分析提供借鉴意义。
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如何报名:
如果您计划参加,可以通过以下四种方式报名,为保证讲课质量,报名人数有限,建议您提前报名!
1. 请点击网页上方“我要报名 sign up”。
2. 将 “2020 GI+姓名+单位+邮箱+电话+研究方向”发送到marketing@cloudscientific.com,即可。
3. 关注“康昱盛”公众号,发送“2020 GI +姓名+单位+邮箱+电话+研究方向”到公众号报名。
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4. 直接通过电话报名,电话: 021- 54975000

备注:您提交报名信息后,我们会在一个工作日内通过电话或者微信联系您,并在网络讲座开始当日为您提供网络授课地址,您可以与您的同学或同事共享学习!

关于GENEVESTIGATOR
GENEVESTIGATOR®是基因表达的高性能搜索引擎。它集成了上万由专家人工精选、注释的公共芯片和测序的实验结果,将基因在不同的生物环境中,如疾病、药物、组织部位、肿瘤、细胞系或基因型等条件下的表达进行了归一化和可视化,以探索不同生物环境下,基因的表达情况以及基因与生物环境的潜在联系。

关于IPA(Ingenuity Pathway Analysis)
IPA(Ingenuity Pathway Analysis)基于后台高度结构化的Ingenuity Knowledge Base,包括人工阅读提取的几百万条公开发表的科研成果和报告,可用于查询相关基因,药物和疾病的最新研究进展,探寻和构建基因与基因间,基因与疾病间的互作调控网络。也可以用于分析、整合、理解自于基因表达,microRNA,SNP,RNA-Seq, SNP-Genotyping微阵列的数据,代谢物组学和蛋白质组学的数据,和一些可产生基因、化学品列表的小规模实验的数据,得到可靠深入的分析结果。每年引用IPA发表的文章超过3000篇,目前总引用文献数已超过33000篇,是领域内使用范围广认可度高的通路分析工具。

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