靶标预测与安全性分析平台
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CLARITY®是由 Chemotargets SL (www.chemotargets.com)公司推出的药物发现平台,该平台通过模块化的计算框架,统一关联了多种信息空间(分子、生物靶标、安全终点、代谢物),并进行结构化整合加工,以便进行系统化数据探索和深度信息分析。

CLARITY®V4.0涵盖3个主题 :
PHARMACOLOGY (Molecule–Target)
TOXICOLOGY (Molecule–Safety)
METABOLISM (Molecule–Metabolite)

4个功能模块:
Drug Explorer, FAERS Explorer, MedChem Explorer Predictive Analytics (包括 Panels)。
CLARITY®有基于web端的图形用户界面(GUI),用户可直观、交互式地运行软件并探索结果;也有命令行界面(CLI)参数,供用户本地部署和高通量调用。

Drug Explorer

  • 探索 CLARITY®数据库,其中包含6,443种药物的(已知的和预测的)药理学、安全性和代谢背景数据。

    Welcome page: ATC treemap


    应用:    
    ● 药物安全性 — 探索药物的药理学和安全性的背景数据,或与特定靶点或安全事件相关分子的背景数据。    
    ● 药物代谢安全性评估 — 探索药物代谢产物、药理学和安全性相关信息。    
    ● 药物设计— 通过新颖的子结构搜索功能识别警示结构。    

    Welcome page: ATC versus. Targets heatmap

FAERS Explorer

  • 访问与3054种药物相关的1860万份不良事件报告。这些信息是基于2004年至2020年12月期间收集的数据,并通过每季度更新的FDA不良事件报告系统(FAERS)报告进行访问。 FDA-CDER与Chemotargets SL的合作也使得1969年至2004年的数据被纳入其中,此前公众无法获得这些数据。

    Welcome page


    应用:    
    ● 安全性评估 -查找药物报告中包含的具体信息:    
    - 人口统计数据: 性别、年龄、体重    
    - 管理: 报告人、结果、报告日期    
    - 治疗相关数据: 适应症、给药途径、联合给药、不良事件、严重程度、可疑性    

    Drug details dashboard

MedChem Explorer

  • 访问完整的CLARITY化学库,探索520万个分子中的骨架和取代基的多样性(其中260万分子可通过三个化学供应商目录获得)。

    Welcome page


    应用:    
    ● 药物设计—进行子结构、骨架和分子搜索,并从供应商目录中订购化学品。    
    ● 骨架跃迁 — 寻找与指定骨架相似的骨架。    
    ● 药物重定位— 查找具有某个共同子结构或骨架的分子集的药理学和安全性信息,并提供化学品供应商目录中感兴趣的分子的概况。    

    Scaffold dashboard

Predictive Analytics

  • 以用户为中心的工作区,用于准备/处理/存档待预测分析分子集。

    List of molecule sets


    应用:    
    ● 药物安全性评估— 计算预测并分析结果。    
    ● 药物设计— 识别警示结构并获取实验分析计划指导。    
    ● 药物发现— 支持靶标解卷积和作用机制阐释。    
    ● 药物重定位— 确定分子的药理学和安全信息。    

    Molecule set results

Panel Manager

  • 访问5,078个药理学和安全性模型信息(包括训练集、验证及置信度参数的元数据)和10个用于分子分析的predefined panels。

    Welcome page


    应用:    
    ● 虚拟筛选— 创建customized panel或使用predefined panel。    
    ● 分子建模— 确定现有模型的稳健性。    

    Pharmacology model documentation

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