• 相关产品 +
  • 相关服务 +
  • 相关应用 +
  • 相关案例 +
  • 相关下载 +
  • meta BioEddie,BioEddie,

咨询信息

我们的产品覆盖了化学信息学,生物信息学,以及实验室信息管理
针对您的研究需求

我们为您选择最适合您的产品
上传时间:2017-07-10 14:57:14
为了更好地编辑和浏览生物大分子,ChemAxon发布了一个新的可以桥接化学小分子和生物大分子的不同表达方式的编辑器BioEddie,可以表达从完全明确定义的实体到完全未知的实体,从明确的化学描述到各种成分混杂的对象,从生物序列到新兴的生物偶联物。它除了让客户可以轻松的从序列和原子两个不同的级别来定义、显示和共享结构复杂的生物大分子,而且提供了基于JavaScript技术的直观、友好的用户界面,可以在网页浏览器上轻松运行。
  • 产品特性
  • 产品演示
  • 常见问题
  • BioEddie
     
    为了更好地编辑和浏览生物大分子,ChemAxon发布了一个新的可以桥接化学小分子和生物大分子的不同表达方式的编辑器BioEddie,可以表达从完全明确定义的实体到完全未知的实体,从明确的化学描述到各种成分混杂的对象,从生物序列到新兴的生物偶联物。它除了让客户可以轻松的从序列和原子两个不同的级别来定义、显示和共享结构复杂的生物大分子,而且提供了基于JavaScript技术的直观、友好的用户界面,可以在网页浏览器上轻松运行。



    支持多种生物大分子类型
    BioEddie可以轻松处理各种不同的生物分子,例如肽链、寡核苷酸、蛋白、抗体-药物偶联物(ADC)等,包括含有非天然的和化学修饰组分的生物分子。用户可以方便的编辑和浏览生物大分子序列及原子水平结构。



    丰富的单体模板库
    BioEddie提供了一个基本的单体模板库,方便用户结构编辑时使用。单体模板库主要包括以下几类:
     氨基酸类
    天然氨基酸、d型氨基酸、取代氨基酸等
     化学取代基
    氨基、乙酰基等
     核酸类
    碱基、磷酸、糖基等
     大基团取代
    muc1粘蛋白等

    除了已有的基本单体模板库,用户可以根据自己的需求定义新的单体模板,也可以对模板库中的单体进行修改和更新。自定义的单体模板也可以导出到xHelm格式的文件中,方便不同用户之间的数据交流。



    快速地结构序列输入
    用户可以直接输入氨基酸或者核苷酸序列,BioEddie能够自动识别氨基酸及核苷酸,并且生成连接键。如果输入有错误则会提示用户。在结构显示窗口按照默认的顺序显示,氨基酸序列从氮端到碳端,核苷酸序列从5’到3’。



    灵活的结构编辑
    BioEddie在结构编辑页面提供了专门的序列编辑窗口,用户可以直接对序列进行编辑。序列的修改将会同步更新到结构显示。利用单体模板库,用户可以通过简单地拖拽将模板库中的组件插入结构中。另外,不同的单体之间的连接键也可以灵活地设置,例如定义连接的位置等。



    支持通用的文件格式
    BioEddie可以支持HELM及Mol格式的文件导入及导出。HELM是由 Pfizer, AstraZeneca, GSK等联合发布的用于表述复杂生物大分子结构的标记方法。Mol为一种通用的分子结构格式。这些通用的文件格式也保证了不同软件之间的数据交流。另外,在编辑结构时,可以直接保存当前的绘制任务,方便用户随时继续之前的结构编辑。

  • 生物大分子结构编辑