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咨询信息

我们的产品覆盖了化学信息学,生物信息学,以及实验室信息管理
针对您的研究需求

我们为您选择最适合您的产品
上传时间:2017-04-21 17:35:44
Chemicalize是ChemAxon发布的用于化学计算、检索以及文本挖掘的在线平台。用户可以免费注册和使用,通过浏览器访问Chemicalize就可以提交计算任务,免去了软件安装的麻烦,计算工作全部由Chemicalize服务器完成,节省用户的计算资源。
  • 产品特性
  • 产品演示
  • 常见问题
  • Chemicalize
     
    Chemicalize是ChemAxon发布的用于化学计算、检索以及文本挖掘的在线平台。用户可以免费注册和使用,通过浏览器访问Chemicalize就可以提交计算任务,免去了软件安装的麻烦,计算工作全部由Chemicalize服务器完成,节省用户的计算资源。
    Chemicalize地址: https://chemicalize.com/

    基于结构的性质预测
    Chemicalize可以帮助用户进行基于化学结构的性质预测,计算功能仍然在不断地增加,目前已经包括元素分析、化学名称及标识符、pKa、logP/logD以及溶解度等。
    化学结构的基本性质预测完全免费,一些特定的性质计算采用积分制,每个账号每个月可以免费获得100个积分,满足用户的一般计算需求。



    灵活的输入方式
    用户可以多种方式提交化合物信息。Chemicalize支持多种类型的化合物名称及标识符,例如IUPAC名称,SMILES,InChI,通用名,商品名等。也提供了在线化学结构编辑器,用户可以在线绘制结构。另外,还可以直接将化学结构文件上传到Chemicalize。

    丰富的性质预测
    Chemicalize可以不用credits进行一些基本性质预测,包括分子量、分子式、元素组成、类药五规则等。更多的性质预测根据用户的选择会需要数目不等的credits。目前可以支持下列性质的预测:
    - 化学名称及标识符,包括IUPAC名称、通用名、SMILES、CAS以及InChI等标识符
    - 结构及几何性质,包括氢键供体/受体数目、形式电荷、可旋转键、范德华体积、极性表面积等
    - pKa及等电点,预测强碱或强酸条件下pKa值,并且提供不同PH环境下不同质子化状态的分布
    - LogP/LogD, 预测不同PH环境下的LogP及LogD
    - 溶解度,预测水溶性以及不同PH环境下的溶解度
    - NMR,预测化合物氢谱,详细的列出每个氢原子的位移、裂分等

    多种类型的计算结果下载
    用户在Chemicalize中可以将计算结果直接打印,也可以将数据下载。也可以打印保存成PDF文件。Chemicalize提供一键下载全部计算结果的原始数据,化合物结构将以sdf和mrv格式保存,各类计算结果将保存成csv格式文件。

    方便的历史记录管理
    用户注册Chemicalize之后,将自动记录每个账号的计算结果。这样有效地减少用户重复计算的工作。方便用户查阅以前的计算结果,并且不需要额外的credit。

    化合物查询
    Chemicalize提供了数据库检索页面,用户可以进行基于文本和基于结构的检索,在线检索包含该化学结构的文档。目前数据库已经包括Wiki百科及近5年的USPTO专利。



    支持多种复杂的提问结构
    在进行结构检索时,Chemicalize支持多种高级结构检索,例如原子列表,键列表,性质检索,重复单元,可变的取代位置,同系取代基等。这些功能可以帮助用户定义一些复杂的提问结构,满足实际工作中的需求。

    结构检索
    Chemicalize默认进行子结构检索,检索结果会按照重原子数目进行排序。同时提供了sdf格式下载化学结构。检索结果自动计算化合物基本性质,用户也可以通过超链接方便地进行更多性质的预测。显示文档检索结果数目,用户可以快速查看文档检索结果。

    文档检索
    Chemicalize能够自动识别文档中的化学名称,支持化学结构及文本组合检索。用户可以用布尔运算符及通配符建立检索条件。在检索结果中,匹配的化学结构信息将以高亮标示出来,方便用户浏览。

    网页化学结构提取
    Chemicalize的Web viewer可以帮助用户从网页中识别化学结构名称,并且将这些文本格式的化学名称转换为化学结构。用户只需要提交网页的URL,Chemicalize将自动对网页进行注释,在Web viewer中可以浏览注释后的网页及提取的化学结构。



    多种化学名称识别
    Chemicalize可以识别多种类型的化学名称及标识符,例如IUPAC名称、通用名、InChI以及SMILES。在Web viewer中,识别出来的化学名称及标识符将会以灰色高亮标示出来。

    自动提取化学结构
    Chemicalize会自动将网页中识别的化学名称及标识符转换成对应的化学结构,并且在Web viewer左侧栏以列表的形式显示所有的化学结构。

    化学结构列表
    在提取化学结构时,Chemicalize会统计该化学结构在网页中出现的次数,并标示在化学结构的左上角。用户在列表中选择化学结构,网页中对应的化学结构原文将以黄色高亮显示,方便用户定位该结构在网页中出现的位置。

    化学结构导出
    提取的化学结构列表可以直接下载,保存为sdf格式的文件,除了化学结构,Chemicalize会自动计算化学结构的分子式及分子量,用户可以直接在sdf文件查看。

    化合物管制信息查询
    Compliance Checker可以帮助用户在线检查化学在不同国家的管制信息,主要包括麻醉药、精神药物、爆炸物、有毒及有害物等。



    目前Compliance Checker可以检查全球18个国家的管制信息,用户可以自由选择感兴趣的国家,根据选择的国家数量使用不同数目的credits。
    用户提交化合物信息,Chemiclaize可以检索对应国家的法律法规,以及管制药物的名称。用户可以直接通过超链接浏览该管制信息原始的法律法规。