• 相关产品 +
  • 相关服务 +
  • 相关应用 +
  • 相关案例 +
  • 相关下载 +
  • meta MarvinSpace,MarvinSpace,

咨询信息

我们的产品覆盖了化学信息学,生物信息学,以及实验室信息管理
针对您的研究需求

我们为您选择最适合您的产品
上传时间:2017-07-20 09:30:00
MarvinSpace显示和操作大分子的3D视图工具。可支持不同的文件格式,用户可以操作3D分子结构,同步视图并调整高质量的3D显示。
  • 产品特性
  • 产品演示
  • 常见问题
  • MarvinSpace——高性能的3D分子结构视图工具
     

    显示和操作大分子的3D视图工具。可支持不同的文件格式,用户可以操作3D分子结构,同步视图并调整高质量的3D显示。

    增强型大分子可视化

    支持最广泛的化学结构文件格式

    MarvinSpace可以打开各种大分子文件(如list)和很多种标准化学结构文件(如mol, sd或者SMILES)。用户还可以连接PDB数据库,并通过简单的输入所需蛋白的PDB编码来提取蛋白结构。
    蛋白属性文件,如Gaussian立方体文件或者CHARMM网格文件,可以在MarvinSpace中显示,来支持计算化学和分子模拟工作人员的工作。


    高质量视图和图片的生成

    MarvinSpace将鼠标操作记录到一个日志文件中,因此每个视图调整点都可以进行回溯,支持后续的分析工作。调整后的视图可以保存为不同分辨率的各种标准格式的图片,如png, bmp, jpg等。

    高级3D视图

    支持各种主要的表面的表达,康诺利,范德华,滴状表面和溶剂易近的表面都可以生成,支持蛋白内腔与配体形状的可视化查看。为了保证性能,我们采用了triangle reduction技术,支持快速分子表面相互作用,即使是大分子之间的相互作用。表面可以针对原子和残基类型、B因子,静电可能性,或者其他容量参数显示不同颜色,以点线、网格、填充或透明等模式来显示。各种个性化的属性匹配功能,为属性匹配、插值、叠加和颜色混合等各种操作提供了灵活性,来支持对分子对接结果或者X射线、NMR、分子动力学模拟分子结构快照的个性化显示。同步的多单元格的视图也可以用来直接比较多个分子结构。


    高级3D操作

    内嵌在大分子文件中的组分,如分子链、配体、离子、水、分子等,都能自动识别出来并分类。键的角度、距离和两面角都可以交互式的进行测量和显示。


    标准的3D可视化

    MarvinSpace可以球棍、虚实线框的方式来显示大分子和化学结构,也可以cpk,残基,分子链或常规的模式来进行着色。可以为原子、残基和二级结构添加个性化标签。深度线索,雾化效果,剪切板,抗混叠等功能进一步支持高质量的图片生成,用于出版。

    标准的3D操作

    所有基础的3D操作,包括3D旋转,翻译和缩放都可支持。用户可以对每个组件进行选择、显示、隐藏、删除或褪色等操作。
    支持先导化合物的优化

    绘制药效团模型

    MarvinSpace可以为原子设置药效团属性,用户可用氢键给体、氢键受体、疏水性、芳香性、阴离子、阳离子、非特定原子药效团等方式来建立药效团模型。


    通过配体匹配来评价SAR

    基于ChemAxon技术的严格而灵活的配体空间匹配,最大公共子结构和药效评分等功能可在MarvinSpace中操作,因此可以轻松的进行药效团重叠性研究。
    另外,灵活而严格的配体空间匹配可以在蛋白内腔中进行,为配体结合提供初步的定量信息,加速先导化合物优化过程。


    MarvinSpace软件安装包下载