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我们的产品覆盖了化学信息学,生物信息学,以及实验室信息管理
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  • Scaffold来自于美国Proteomesoftware公司,是一款著名的可视化与验证质谱搜库结果的软件。它能够导入分析目前大多数搜库软件的检索结果,并能对来自于不同软件、不同仪器、不同实验的结果进行自由组合与可视化评估并导出各类详细报告和图表,是分析搜库结果最佳、最便捷的软件。
  • 如何使用Scaffold导入定量数据 定量数据导入总体方法与Scaffold相同,相关兼容性和操作说明均可在定性方法说明中找到。唯一的区别在于新建project时选择正确的定量技术即可。不同类型的定量数据所需要的结果格式不同,尤其是Silac定量方法需要一级谱峰信息,所需的文件与普通定性、iTRAQ定量等不同。
  • iTRAQ (Isobaric tag for relative and absolutequantitation)和Tandem mass tags(TMT)是目前应用最广泛的两大类化学标记定量技术,其原理一样,区别在于分别由AB和Thermo公司开发销售。 简单来说,iTRAQ、TMT技术的原理是依赖于肽段末端不同的同位素标记以区分样品,二维色谱有效分离,对标记试剂所携带的报告离子强度进行计算以匹配对应肽段量,整合各定量肽段的信息以得出蛋白整体变化趋势。 iTRAQ、TMT技术的优点在于实验流程简单,可以同时标记2-10个样品、样品类型适用性广。缺点在于价格较为昂贵,对LC-MS体系稳定性,分离效率,仪器优化要求较高,定量动态范围较低,低丰度蛋白定量准确性较差。 无论是研究者本人进行iTRAQ、TMT实验还是委托他人进行实验,在进行数据分析或查看分析结果前,都需要对标记效果、LC分离效果进行质控评估,在查看定量结果时,也