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上传时间:2016-04-13 16:16:20
如何查看Scaffold定性结果

1.Scaffold分析的结果保存在SF3格式的文件中,如果需要查看他人分析完毕的SF3结果文件,请下载Scaffold Q+S的viewer并安装,即可打开结果文件;http://www.proteomesoftware.com/products/free-viewer

2.打开该文件后,如果跳出过期界面,请点击continue in viewer     mode即可

3.Scaffold查看结果的界面:Scaffold的结果分Samples,Proteins,Similarity,Quantify,Publish,Statistics 六个大类分别显示。

4.Samples界面介绍:

我们可以看到以当前质控标准所鉴定得到所有蛋白列表,及相关简要信息。同时上方控制栏可以非常方便的对结果进行质控切换、显示类型切换、翻译后修饰筛选和高级搜索筛选。如果在前一步分析数据时导入了Uniprot的GO数据库,那么当前界面同样会显示各蛋白GO注释的结果信息。如果需要查看具体某个蛋白的详细结果匹配,双击目标蛋白即会自动切换到Proteins界面


5.不同显示选项对结果的影响,Bio Vew下方的蛋白数量并非总体质控后的鉴定数量,而是经过筛选、过滤后的自定义结果数量:



7. Proteins 界面介绍:

单击Proteins标签或双击Samples中的蛋白名称后,Scaffold会切换到详细蛋白视图,


8.    Similarity模块用于查看各个蛋白家族中不同肽段的权重,具体算法请参考http://www.cloudscientific.com/Detail/DownloadTemp/125.html


9. 鉴定结果的谱图鉴定数、Gene Ontology分布等信息


10. Publish界面用于生成搜库及质控过程的步骤和相关材料


11. Statistics面板对所有分析结果进行统计分布分析



12. 导出界面介绍


13. Tips,当您在任何图标界面点击右键,均能够对该表格、图片进行导出