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我们的产品覆盖了化学信息学,生物信息学,以及实验室信息管理
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我们为您选择最适合您的产品
上传时间:2017-01-12 15:32:26
Methyl-Seq 数据分析

甲基化检测

 对每个样本的CG,CHG,CHH型甲基化进行统计
 甲基化检侧算法兼顾到了重亚硫酸氢盐转化效率,测序错误率,覆盖度,碱基质量以及甲基化率



数据导入以及质量控制

 允许导入Bismark软件比对结果(BAM/SAM)
 对比对前后,目标区段富集以及建库进行质量控制
 对甲基化水平,CpG位点的覆盖度进行统计



样本内甲基化分析

 对目标区域的样本进行低,中,高甲基化密度识别



差异甲基化的计算

 寻找差异的甲基化位点
 寻找差异的甲基化区段



甲基化效应分析

 从甲基化检测和差异甲基化结果中确定基因组中甲基化或差异甲基化的胞嘧啶
 对于检测到的甲基化鉴定其效应



甲基化结果展示

 对样本感兴趣的甲基化位点或区域进行可视化
 交互式基因组浏览器-重亚硫酸氢盐转化的reads可以被个性化的展示
 甲基化水平统计图帮助察看reads的覆盖度在甲基化胞嘧啶与非甲基化胞嘧啶的比例