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上传时间:2016-06-16 10:39:45
LAMP Designer为LAMP设计高效引物,LAMP可以在等温条件下扩增DNA和RNA,避免了PCR的温度设置。这项技术依赖自动循环和DNA聚合酶介导的链置换合成DNA,不到一小时的时间内可以将DNA从几份扩增到109份。LAMP偶联的逆转录可以用来扩增RNA序列。
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  • LAMP Designer为LAMP设计高效引物,LAMP可以在等温条件下扩增DNA和RNA,避免了PCR的温度设置。这项技术依赖自动循环和DNA聚合酶介导的链置换合成DNA,不到一小时的时间内可以将DNA从几份扩增到109份。LAMP偶联的逆转录可以用来扩增RNA序列。
     
     
     
    LAMP使用四种特别设计的引物(两个内部和两个外部)识别靶DNA的六个显著区间。四条引物与DNA的杂交是决定LAMP效率的关键步骤,所以这四条引物的设计是影响实验成功的关键。
     
     
     
    避免交叉同源性
     
    LAMP Designer自动注释BLAST搜索结果,并避免根据这些与数据库有显著交叉同源性的序列设计引物。
     
     
     
    BLAST验证
     
    通过BLAST搜索可以验证引物的特异性。
     
     
     
     
     
    多重LAMP引物集合
     
    为一个序列设计引物,可以进行检查,用于多重实验。该程序会显示出交叉同源序列和设计引物间最稳定的自由能。
     
     
     
    结果导出
     
    设计的引物集以及他们的属性可以导出为标准的CSV或Excel格式。
     
    数据和数据库管理
     
    多个实验数据可以通过为每一个实验创建单独的项目来进行管理。它可以维护包含序列信息和搜索结果的本地数据库。