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我们的产品覆盖了化学信息学,生物信息学,以及实验室信息管理
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我们为您选择最适合您的产品
上传时间:2016-06-16 10:41:06
Beacon Designer™用来自动设计实时定量PCR的引物和探针。世界各地的分子生物学家们运用Beacon Designer™软件成功的完成了实时定量PCR实验。它大大的减少了由于实验失败带来的时间和经费的浪费。Beacon Designer™软件能够满足您的实时定量PCR引物和探针的设计所需,并且通过了多次的验证。
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  • Beacon Designer™用来自动设计实时定量PCR的引物和探针。世界各地的分子生物学家们运用Beacon Designer™软件成功的完成了实时定量PCR实验。它大大的减少了由于实验失败带来的时间和经费的浪费。Beacon Designer™软件能够满足您的实时定量PCR引物和探针的设计所需,并且通过了多次的验证。一个客户如是说:我们喜欢你们的程序,有了它,我们不必再用其他三或四个程序来验证我们设计的探针是否能非特异结合其他序列。此外,节省了经费,我们不用买昂贵的标签探针来检测哪个探针最有效。- Dr. Gale Newman, Dept. Micro, Biochem, Immuno Morehouse School ofMedicine, Atlanta, GA
     
     
     
    特异性和高效性:Beacon Designer如何做到的?
     
    您能够通过BLAST搜索比对查找的序列以及寻找模版结构。当设计引物和探针时可以用到这些搜索的结果。设计过程中,与模板结构同源交叉的区域能够避免随意配对。
     
     
     
     
     
    可用的设计选项
     
     
     
    SYBR® Green Assay Design
     
    SYBR® Green 是实时PCR中最常用的化学分子。BeaconDesigner™可以设计SYBR® Green引物,并且可以帮助您进行前导引物评估。您可以自主控制设计参数或者直接选择由专家筛选得到的默认值。同时您还可以针对特殊的实验需要自己设置默认值。
     
    除了可以在目的基因的任意位置中定位引物,Beacon Designer 还可以跨内显子-内显子或外显子-外显子设计引物。跨外显子内含子连接的引物设计有助于选择性地从gDNA中扩增得到cDNA。
     
     
     
    HRMA Assay Design
     
    Beacon Designer提供了一个检测突变的高效方法。相对于以探针为基础的基因型分析,HRMA更经济实惠。该软件运用一种特有的专利的算法,能够设计出检测突变的最好引物HRMA引物.HRMA引物将感兴趣的突变处设计于最短的扩增子,能够检测到解链温度变化。引物避免了模板的二级结构,保证了有效的引物延伸。HRMA引物可以在NCBI上比对核苷酸信息来检测特异性。此外,预引物和已经发表的引物同样可以用来检测。
     
     
     
    双标签探针设计
     
     
     
    Beacon Designer目前支持四种探针染料:
     
    TaqMan® 探针
     
    使用Beacon Designe能够帮助您研究不同基因表达以及单核苷酸多态性。同样,您可以选择LNA替代taqman探针,它比taqman探针更加稳定。Beacon Designer™可以帮助您设计甲基化的taqman探针。MethyLight 是一个高通量的分析,用来区别甲基化和非甲基化的DNA。通过Beacon Designer™,可以通过设定甲基化和非甲基化链,以及未处理DNA序列的寡核苷酸来适当地控制引物和探针的设计。您可以使用这些化学物评估pre-designed/published的引物或TaqMan®探针。设计完成之后,系统会根据不同的寡核苷酸属性将设计的结果按性能排序并给出一个结果列表。
     
     
     
    分子信标
     
    设计或评估标准分子信标或用于NASBA分析的分子信标。NASBA是一个依赖引物的技术,用于单一混合物在一个温度下的连续扩增。您可以设计单一温度或多反应的分子信标。
     
     
     
    Scorpions®
     
    Beacon Designer支持Scorpions引物和探针的设计。Scorpions分析不依赖于探针的酶活性口袋。引物和探针在反应过程中紧密的偶联。
     
     
     
    FRET探针
     
    Beacon Designer可以对之前设计的FRET探针进行再设计和评估。BeaconDesigner 中,FRET探针能与SYBR® Green偶联在一起。
     
     
     
    多重实时PCR分析
     
     
     
    利用Beacon Designer™,您可以根据多重实时PCR分析设计TaqMan®,可多达5条包含参考基因选择的序列。