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我们的产品覆盖了化学信息学,生物信息学,以及实验室信息管理
针对您的研究需求

我们为您选择最适合您的产品
上传时间:2016-06-16 10:40:59
Primer Premier的搜算法利用临近热力学算法计算最准确的解链温度,找到最佳的PCR、多重和SNP基因型分类引物。软件报告最佳引物之前,会根据引物的二级结构、二聚体、发夹结构、同源性和物理性质进行筛选,并会根据其性能优越性生成一个排名顺序。您可以通过计算器轻松地编辑序列以及分析引物设计结果。



从NCBI 下载感兴趣的基因,选择搜索范围,Primer Premier会自动为您选择最佳引物。



SNP基因分类引物设计

利用 Primer Premier您可以从dbSNP数据库载入序列并设计引物。数以百计的未发表的SNPs也可以指定作为GenBank/dbSNP 标准文件的变化特征进行加载。指定SNPs后,可以设计引物用于基于探针化学的检测。

多重引物设计

针对复合实验来说,Primer Premier可以对序列进行成批引物搜素,然后检测引物设计的交叉反应活性,进行多重引物设计。Primer Premier检查所有可能的反应活性并显示每个寡核苷酸形成的最稳定的结构,这个功能可以减少错误引发并保证好的信号强度。



自动回避同源模板区

Primer Premier 自动注释BLAST搜索结果,并避免在有显著同源性的区间设计引物。同源区间会在序列视图中高亮显示,并且不参与引物设计。



延伸温度下模板的结构状态可能会应影响引物的延伸。为避开这些区间,您可以指定一个折叠温度,该程序会利用特有的算法检查在该温度下所有序列可能折叠形成的二级结构。这些会折叠形成二级结构的区间会在序列视图中通过下划线显示,并且不参与引物设计。

排除同源区使寡核苷酸具有高度特异性,同时,排除模板结构的影响提高了引物设计的效率。

手动引物搜索

Primer Premier 为用户提供引物设计的完整控制权。使用手动引物搜索选项,用户可以选择模板序列中的任意位置设计正义或反义引物。 Primer Premier 可以快速计算并显示出新引物的特性,用户最终选中的引物会显示在主窗口的引物序列视图中。

编辑模板序列

模板序列式是可以被用户编辑和修改的,利用常规的剪切/复制/粘贴功能可以对碱基进行修饰。使用“删除”按钮,可以删除不需要的区域序列。用户也可以对序列进行注释,并将其保存以供将来参考。
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