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上传时间:2016-06-16 10:41:52
AlleleID® 是一款可用于细菌鉴定,病原体检测以及物种鉴定的综合性桌面工具。通过核心的多序列比对,AlleleID® 可以设计用于物种/交叉物种鉴定的基因芯片探针以及用于实时PCR的SYBR® Green, TaqMan® MGB, TaqMan® 探针, Molecular 标签以及实时PCR引物。AlleleID® 也支持可变剪切片段检测的微阵列实验设计。
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  • AlleleID® 是一款可用于细菌鉴定,病原体检测以及物种鉴定的综合性桌面工具。通过核心的多序列比对,AlleleID® 可以设计用于物种/交叉物种鉴定的基因芯片探针以及用于实时PCR的SYBR® Green, TaqMan® MGB, TaqMan® 探针, Molecular 标签以及实时PCR引物。AlleleID® 也支持可变剪切片段检测的微阵列实验设计。



    物种鉴定实验/交叉物种化验/等位基因鉴定实验

    AlleleID®根据多序列比对、分析守恒和种属特异性区域排列序列。您可以使用实时PCR引物设计(包含SYBR® Green引物设计)和双标签探针设计(TaqMan® probes, TaqMan® MGB probes and molecular beacons)程序。这些实验旨在于进行菌株检测或者从混合菌株中找到感兴趣的种属。



    AlleleID®通过识别保守区域设计用于交叉物种实验的通用探针。对于相关的生物体,当研究物种的基因组草图不可用时,可以使用AlleleID®来研究其基因表达。这些强大的功能可以帮助您解决很多具有挑战性的难题,例如的检测、鉴定、定量以及污染物、环境等的监测。



    精细计算确保设计成功

    高度特异性寡核苷酸设计回避通过自动注释BLAST搜索结果找到的显著同源性区域。实时定量PCR引物和探针阻止模板形成二级结构提升效率。"Minimal Set",该程序最具创新性的特点之一是可以帮助设计数量最少的等位基因特异性寡核苷酸引物和组合中每个所需物种/菌株/类群的唯一标识双标记探针,有利于降低检测成本。对于种属差异性很大的类群或交叉物种实验,这个功能特别有用。对于已有成熟引物的部分集合,AlleleID®可设计用于剩余序列物种鉴定和类群特异性实验的兼容引物和探针。



    广泛支持实时定量PCR检测和SNP/表达芯片

    AlleleID®可以设计优化引物,实时定量PCR差异基因表达和SNP基因型分类的SYBR® Green引物,TaqMan®探针,TaqMan® Minor Groove Binding (MGB) 探针,FRET探针或者分子标签。您也可以设计实时PCR引物和一个单一的SNP检测或表达芯片中高达10000个序列的双标记探针。



    设计Luminex xMAP®分析

    基于Luminex's xMAP®技术,AlleleID®可以设计应用于悬浮实验系统的多重菌株变异途径。如果您研究的是密切相关的生物体,这个功能可以帮助您在一个反应体系中进行等位基因特异性引物延伸(ASPE)和DHA检测。



    用于拷贝数和突变检测的多重连接依赖探针扩增技术(MLPA)

    AlleleID® 是设计合成MLPA探针的唯一解决方案,是由MRCHolland引进的可以帮助研究员在相关条件未知情况下开展研究的技术。是一种快速发展的高通量遗传识别分析方法,可以用于检测外显子缺失、拷贝数变化和CpG甲基化模式。



    多重连接依赖的探针扩增(MLPA)检测拷贝数突变检测

    ®AlleleID是唯一的方案,设计合成探针MLPA或多重连接依赖的探针扩增技术的引进使研究者把这种技术扩展套件无法在适当的时候由MRC荷兰。这是一个快速增长的高通量遗传分析方法。它可以检测外显子缺失,拷贝数变化和。这是符合成本效益的,敏感的,具体和可重复性。



    AlleleID® 还可以设计用于PamGene阵列的mRNA 特异性、DNA 特异性以及突变特异性MLPA探针。这可以让PamChip®用户自己设计探针,用于PamGene高精度检测平台来检测感兴趣的基因。结合这两种技术,6小时内的拷贝数变化和突变可以在被轻易地检测到。