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咨询信息

我们的产品覆盖了化学信息学,生物信息学,以及实验室信息管理
针对您的研究需求

我们为您选择最适合您的产品
上传时间:2016-06-16 10:46:44
Spark为您的项目生成新颖和多样性的结构。Spark使用Cresset的“场技术”来为您分子的关键部分寻找生物等效替换,让您能够在新的化学空间上找到新的结构。




  • 产品特性
  • 产品演示
  • 常见问题
  • 使用Spark计算化学软件,在保留活性并且最小化ADME和毒性问题的同时,来优化您的先导化合物并且改善您的IP位置,或者完全改变骨架。



    Spark有一个容易使用的界面,能够从最初的2D结构快速生成一系列先导分子,帮助您选择您所需要具有的属性的最创新和最易处理的先导化合物。



    选择Spark

    使用Spark,您将可以:

    ·克服“chemotype trap”,在新的化合物结构空间产生先导分子最创新的想法。

    ·使用过滤器找到物理化学性质和生物活性正确组合的结果

    ·通过选择允许替换部分的化学结构来找到合适的结果

    ·详细并排列出结果,或者将相似的化学骨架进行聚类

    ·从真实的,出版的或者未知的化合物数据库中搜索部分基团

    ·基于您的可用试剂或者您私有的化合物创建您自定义的数据库


    产品特色

    特性 Spark GUI Spark CLI
    从三维构象或者二维分子结构出发
    ChemDraw或其它应用中粘贴起始分子  
    将一个标准工作流部署到KNIME或者PipelinePilot中  
    在所有新键中控制原子允许的元素和杂化
    使用约束条件来确保维持特定的相互作用
    对多个参考分子的结果进行评分
    一次搜索一个数据库,检查运行之间的结果,将新的结果附加到现有的项目中  
    通过在工作启动时选择需要搜索哪些数据库,从而达到在一个过程中搜索多个数据库
    浏览结果分子中的2D结构  
    得到每个分子与起始分子的三维比对结果
    在一个直观地径向图中查看每个结果分子的物理性质  
    基于Mucrko骨架将结果聚类到独立的化学类型中
    利用骨架或者取代模式将结果进行聚类  
    确保每个新想法满足共同的或者项目对于标准物理属性(如logP、TPSA、分子量等)的指导方针
    将特殊的结果标记为进行进一步研究的重点  
    将结果导出成能在Excel,Spotfire等中使用的csv(结构导出成smiles字符串)  
    基于您私有的片段创建自定义的数据库
    将公共数据库进行片段化,从而创建自定义的数据库
    控制存储在数据库中片段的大小和柔性
    使用容易理解的综合规则将您可用的试剂转化为数据库进行搜索
    创建您自己的规则,用于将试剂转化为可被搜索的片段数据库





    相关资源



    Cresset命令行二进制文件

    用于创建Spark试剂数据库的当前规则



    案例研究

    使用Spark生成库设计的想法:Spark是用于产生一个数据库可能起点的新的想法,以S-adenosylmethionine (SAM),一个生物甲基化合成纤维的辅助因子为例。

    通过nGluR5调节剂的新生物电子等排体来发现潜在的新的IP:使用分子场的骨架跃迁技术识别了在这个繁忙的治疗领域中现有的和潜在的新的知识产权。

    Beyond Markush:保护活性而不是化合物结构:提供一个更准确和有用的化合物活性和属性的展示方式。

    生物电子等排体作为药物开发的候选:搜索具有相关性、不明显的建议的生物电子等排体结果,这些建议对于药物开发过程具有重要影响。