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我们的产品覆盖了化学信息学,生物信息学,以及实验室信息管理
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上传时间:2016-06-16 10:43:47
一个创新的MSn数据分析工具
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  • 一个创新的MSn数据分析工具

    SimGlycan®可以分析质谱数据预测聚糖和糖肽的结构。SimGlycan®接受MS / MS实验数据,并将数据与自有数据库的推定片段匹配,生成一个可能的候选结构列表。每个结构都按其与实验数据的匹配程度进行标注。多糖的结构说明中,除了结构信息,其他可能分子结构的生物信息,如多糖种类((N-连接,O-连接,肝素,脂多糖等),反应,通路和酶等信息也可以很简单地查询到。然而在糖肽定性分析中,蛋白质ID,名称,来源,分类,种类,多肽序列,多肽质量等信息也可以查询到。



    多糖和糖肽MS / MS数据分析工具

    ®SimGlycan是一个全面的聚糖和糖肽MS / MS数据分析工具,它具有更多的创新模块,可以采用多级/顺序质谱(MSn)来验证识别结构。 SimGlycan®生成一个可以用作数据分析的多糖或糖肽列表作为选定模块,通过计算理论结构与实验数据的符合度来预测结构,大大地节省了您通过光谱分析结构的时间。



    SimGlycan®包括全面的支持信息,包括H,Li,Na,Mg,K加合物以及加合物的组合如Na+H,Li+ H等。



    SimGlycan®全面支持MSn数据分析,协助解决异质性,分支模式和寡糖结构。


    SimGlycan®能够识别复杂的、即使是有取代基修饰的糖胺聚糖结构,如硫酸盐,磷酸盐,乙醇胺等。这个功能有助于核对被取代基修饰的糖残基。



    SimGlycan®还支持来源于LC-MS/MS运行的蛋白水解纯化得到糖蛋白的糖肽分析。为了利用MS/MS数据鉴定糖肽,通过第三方工具鉴定得到的蛋白质ID,蛋白质序列或多肽序列将作为初始数据输入SimGlycan®。SimGlycan®会标识出可能的糖-肽组合,并按诊断离子峰给出排列的顺序。



    用于糖基化研究的聚糖和糖肽MS / MS数据分析

    蛋白质糖基化是指多肽序列修饰上糖残基,是一个关键的翻译后修饰。糖肽具有多种生物功能。为了识别特定结构的对应功能,需要知道各自的glycan残基的详细信息。为理解所有这些现象,糖基化分析引起越来越多人的关注。聚糖也被发现参与许多生物过程,包括胚胎发育,细胞间和细胞内活动,免疫功能的协调,病原体在宿主组织中的归位,细胞分裂过程和蛋白质的规则和相互作用。


    糖蛋白糖基化分析,长期以来一直生物化学的一个具有挑战性的任务。SimGlycan ®可以帮助从现有的glycan MS / MS数据或通过质谱电离技术得到的糖肽片段单个或两个聚糖结构修饰的肽链)。此外,它支持带有不同化学衍生物的多糖MS/MS数据,例如完全甲基化和多种还原末端修饰。用户可以自定义完全甲基化多糖的还原端质量。SimGlycan®支持多种格式的上传文件,包括标准的文件格式以及多种直接来源于质谱的源文件,例如AB SCIEX (TripleTOF™ 5600 System, TOF/TOF 5800, 4800 Plus MALDITOF/TOF™ Analyzer, 4000 QTRAP® and QSTAR® Elite Systems)的,BrukerDaltonics(ultrafleXtreme™ MALDI TOF/TOF, ultraflex™ MALDI TOF/TOF, autoflex™TOF and TOF/TOF, maXis™ UHR-TOF, micrOTOF™, micrOTOF-Q™, solariX™ Qq-FTMS, andamaZon™ ion trap series), Thermo Scientific ( LTQ FT Ultra, LTQ Velos, LTQ XL,LTQ Orbitrap Discovery, LTQ Orbitrap Velos, LTQ Orbitrap XL, MALDI LTQOrbitrap, Orbitrap Elite and Q Exactive) and Waters (SYNAPT G2 HDMS, SYNAPT G2MS, Xevo G2 QTof, Xevo QTof MS, Xevo TQ MS and Xevo TQ-S platforms)。所有这些功能有助于准确地研究蛋白质糖基化,为开发灵敏的分析方法实现糖疗法的完整质量分析提供了坚实的基础。
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