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我们的产品覆盖了化学信息学,生物信息学,以及实验室信息管理
针对您的研究需求

我们为您选择最适合您的产品
上传时间:2016-05-17 14:58:26
基于化学结构的计算/预测工具:ChemAxon Calculators和Calculator Plugins,ChemAxon Calculator 插件套件是一个建立在无可匹敌的高性能和多功能的整合技术上的化学信息学工具包。这套工具提供快速的、精确的、可通过训练集优化的基础理化性质(如logP, logD, pKa等)的计算和预测功能。
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    基于化学结构的计算/预测工具

    ChemAxon Calculators和Calculator Plugins

    ChemAxon Calculator 插件套件是一个建立在无可匹敌的高性能和多功能的整合技术上的化学信息学工具包。它为有着或多或少分子模拟经验的研发人员所面临的很多问题提供了解决方案。即使是几十万、上百万的化合物,所实施的计算和属性预测工具也可以十分快速有效的对它们药理学相关的理化性质和分子描述符进行评价,使之成为强大的产生和优化先导化合物的工具。

    这套工具提供快速的、精确的、可通过训练集优化的基础理化性质(如logP, logD, pKa等)的计算和预测功能。另外它还包括NMR分子谱图的精准预测功能,对化学结构的解析和阐述十分有帮助。除了预测功能,这个套件还包括根据输入的化学结构和用户设置的条件来枚举立体异构体和互变异构体的技术。由于很大比例的类药分子具有弱酸或弱碱性,处于低能量离子化或者互变异构体的各种状态,可靠的预测这些性质对于药理研究或者有机、无机化学工艺的表征有着无价的意义。

    分子属性和描述符计算可以用于评价各种拓扑相关的分子特征。包括简单的元素分析,化学结构主键,氢键以及其他的物理性质,拓扑极性表面积或者分子表面积描述符等,这些描述符可以广泛的应用于生物活性数据和ADME属性的预测,还可用于化合物的分类、聚集、筛选和预测模型的建立。

    ChemAxon为与分子模拟软件(如3D配体几何优化和构象库生成软件)的互动提供了流畅的界面。直观而快速的3D结构调整和分子动态控制工具对于计算化学与药物化学的研发人员都十分有价值。Marvin的用户可以计算局部电荷分布和派生物,这些参数对分子结构的很多理化性质有很大影响,如反应性和药效团特性等。



    Calculator 插件套件包括如下六个插件包:

    化学结构计算包:电荷计算(包括电荷分布,极化率,轨道电负性计算),构象计算(包括构象,分子动力学和3D构象对齐),几何结构计算(包括拓扑分析,几何结构,2D拓扑表面积(FREE),3D分子表面积计算),休克尔计算,折射率计算,氢键给体/受体(HBD/HBA)计算,结构框架计算,化合物名称到结构的转化,Markush枚举功能等。

    质子化计算包:pKa, 主要微征种, 等电位点计算

    油水分布计算包:logP, logD, HLB计算

    异构体计算包:互变异构化,立体异构体,共振异构体计算

    溶解度计算包:溶解度预测

    NMR计算包:NMR谱图预测


    应用方式

    ChemAxon的Calculator插件可以通过基于JChem技术的各种工具进行调用,如命令行、Chemical Terms语言和API等。Calculator插件也可以在各种ChemAxon的桌面程序中使用,如Marvin, Instant JChem, JChem for Excel等。另外Calculator插件也可以在目前很流行的工作流程和数据分析软件中应用,如Pipeline Pilot, KNIME, InforSense和Spotfire.