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上传时间:2016-06-22 10:56:12
MolConverter是Marvin Bean和JChem Suite中包含的一个命令行程序,可以在不同化学结构文件类型间进行格式转换。用户可以指定不同的文档、分子结构文件或者压缩/编码格式的文件进行批量操作。处理化学结构文件时,用户可以通过参数控制如何处理化学结构的某些特性。
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  • MolConverter 在业界标准文件格式之间进行相互转换

    MolConverter是Marvin Bean和JChem Suite中包含的一个命令行程序,可以在不同化学结构文件类型间进行格式转换。用户可以指定不同的文档、分子结构文件或者压缩/编码格式的文件进行批量操作。处理化学结构文件时,用户可以通过参数控制如何处理化学结构的某些特性。

    丰富的功能

    • 化学结构文件支持:MOL, SDF, RXN, RDF (V2000/V3000), SMILES, MRV, CML, PDB, SMARTS, InChI, IUPAC名称,等。
    • SMARTS/SMIRKS(支持递归)
    • 图片格式输出 (JPG, PNG, BMP, POV, SVG, PDF)
    • 非化学结构的数据,如SDF中的数据字段,也可以进行转换。
    化学智能
    • 计算2D/3D坐标
    • 基于字段的数据筛选(SDF导入)
    • 显示/隐藏H原子
    • 化合价检查
    • 自动清除小结构片段,保留最大的结构片段
    • 3D结构标准化的各种参数设置

    命令行工具